品質評価試験 リアルタイム定量PCR（プラスミド残存試験）
プラスミド残存試験
iPS細胞より抽出したゲノムDNAを鋳型として、各プラスミド上の外来遺伝子を増幅する定量PCRを行い、iPS細胞に残存するプラスミドの有無を調べます。 プラスミドコピー数は、内在遺伝子であるFbx15遺伝子5.0x104コピー以上に相当するゲノムDNAに含まれるコピー数として算出します。
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エピソーマルベクター（pCE-hSK, pCE-hUL, pCE-hOCT3/4, pCE-mp53DD, pCXB-EBNA1）を用いて
樹立したiPS細胞に対応 -
7つのターゲット因子（KLF4、SOX2、MYCL1、LIN28A、Trp53DD、OCT3/4、EBNA1）を検出可能※
※検出可能コピー数：10コピー以上
| 検体 | 継代数 | pCE-hSK | pCE-hUL | pCE-mp53DD | pCE-hOCT3/4 | 全ての プラスミドに搭載 |
||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SOX2 | KLF4 | MYCL1 | LIN28A | Trp53DD | OCT3/4 | EBNA1 | ||
| Sample 1 | 7 | N/D | N/D | N/D | 0.019 | N/D | N/D | N/D |
| Sample 2 | 10 | N/D | N/D | N/D | N/D | N/D | N/D | N/D |
| 検体 | Sample 1 | Sample 2 | |
|---|---|---|---|
| 継代数 | 7 | 10 | |
| pCE-hSK | SOX2 | N/D | N/D |
| KLF4 | N/D | N/D | |
| pCE-hUL | MYCL1 | N/D | 0.019 |
| LIN28A | N/D | N/D | |
| pCE-mp53DD | Trp53DD | N/D | N/D |
| pCE-hOCT3/4 | OCT3/4 | N/D | N/D |
| 全てのプラスミドに搭載 | EBNA1 | N/D | N/D |
N/Dは検出されなかったことを示す。
一部のサンプルについて数値を記載しているが、いずれも定量限界以下の値であった。
本結果は、分化誘導後の解析結果と併せて総合的に判断すること。
- 生データ（edsファイル）
- 解析結果（エクセルファイル）
- （信頼性保証およびGMP対応の場合）解析報告書
| サンプル | DNAもしくは細胞ペレット |
|---|---|
| DNA量※ | 5 μg |
| 濃度・必要量 |
50 ng/μL 以上で100 μL 以上 もしくは20 ng/μL 以上で250 μL以上 |
| 溶媒 |
TE、DDW等 （事前にお知らせください） |
※サンプルの定量は分光光度計で行っております。
もし他の種類の機器で測定される場合、測定機器名をお知らせ下さい。
関連情報
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