バルクRNAシーケンス解析

Illumina社のTruSeq Stranded Total RNAを用いてRNAシーケンス用ライブラリを調製した後、Illumina社の次世代シーケンサーを用いてシーケンスを行います。
目標出力データ量をご相談いただけます。
本サービスは、iPS細胞の臨床応用支援を目的としており、iPS細胞を用いて再生医療の研究開発を推進している研究機関・企業を対象に提供しています。

特色

  • Illumina社 TruSeq Stranded Total RNAを用いたRNAシーケンス用ライブラリの調製
  • 他のライブラリ調製キットをご希望の場合はご相談ください
  • Illumina社の次世代シーケンサーを用いてシーケンスを実施
  • FASTQファイルからの解析もご相談いただけます

サンプル条件

サンプル 精製RNA
RNA量 200 ng 以上
濃度 10 ng/μL 以上
RIN値 7以上
OD260/280 1.6以上
溶媒 DDW
  • サンプルの定量はQubitで行って頂くことを推奨しております。
    もし他の機器で測定される場合、測定機器名をお知らせ下さい。

シーケンス機器の仕様

ご要望の出⼒データ量に応じて使⽤するフローセルなどご提案いたします。

NovaSeq6000

フローセルタイプ 出⼒リード数(ペアエンド) 2 x 100 bp 2 x 150 bp
SP (2 lane) 1,300-1,600 M 134-167 Gb 200-250 Gb
S1 (2 lane) 2,600-3,200 M 266-333 Gb 400-500 Gb
S2 (2 lane) 6,600-8,200 M 667-833 Gb 1,000-1,250 Gb
S4 (4 lane) 16,000-20,000 M 1,600-2,000 Gb 2,400-3,000 Gb

NextSeq500

フローセルタイプ 出⼒リード数(ペアエンド) 2 x 75 bp 2 x 150 bp
High-Output 800 M 50-60 Gb 100-120 Gb
  • 出力データ量は目安であり、保証するものではありません。

解析例

  • 24検体のバルクRNAシーケンス解析
  • ライブラリー作製キット: TruSeq Standard Total RNA
  • 使用機種:NovaSeq 6000
  • シーケンス方法:SPフローセル占有、101bpでのペアエンドシーケンス
  • 平均データ量:50Mリード/サンプル

納品物

  • シーケンスデータ(FASTQファイル等)
  • オプションでご依頼いただいた解析データ
  • 作業の概要

バルクRNAシーケンス解析お申込みの流れ

  1. お客様 お申込み

    下記フォームからお申込みください。

    お申込みフォーム

  2. CiRA_F お申込み内容確認

    お申込みいただいた内容の確認を⾏い連絡いたします。

  3. お客様 サンプルのご提出

    サンプルのご提出をお願いいたします。

  4. CiRA_F 品質評価試験

    以下の試験を⾏います。

    • RNAの品質確認
    • ライブラリー作製
    • 次世代シーケンサーを⽤いたシーケンシング
  5. CiRA_F 解析結果のご返却
    費⽤のご請求

    解析結果をご返却いたします。請求書をお送りいたしますので、期⽇までにお⽀払いをお願いいたします。

関連サービス

  • RNA抽出